应用快照:自动液体处理

世界各地的客户已经使用Opentrons自动化各种基本的湿式实验室液体处理任务。这是如何。

注意:除了更复杂的任务,如NGS库制备、核酸提取和qPCR,您还可以使用Opentrons平台自动化一系列基本的液体处理湿式实验室任务。

在此快照中,您将学习如何使用Opentrons硬件、软件、消耗品和协议自动完成基本的移液湿实验室任务,包括试管填充、微孔板填充、串行稀释和化合物串行稀释。您还将学习优化您的实验室工作流程以自动化这些任务的最佳实践,以及哪些任务已经有可下载的Opentrons协议。

常见问题解答

问:Opentrons平台在我的实验室中如何工作?

答:这个平台是开源的,所以任何实验室都可以使用它,可以为不同的工作流程定制,并且不依赖于套件。

问:如何制定基本的液体处理方案?

答:你有三种不同的选择来制定基本的液体处理方案:

—选择1:设计您自己的与我们的互动,用户友好必威体育2021欧洲杯官网工具

选择2:使用我们的开源软件编写你自己的代码Python协议API

—选项3:让我们的应用工程团队为您创建一个协议

问:你有什么事先写好的协议可以让我使用吗?

A:我们有很多可下载的协议协议库,包括基本的湿式实验室液体处理分析:

--归一化

--管填充

--质量规范

--板填充

--整除

--连续稀释法

--&整合

--樱桃采摘

--细胞播种

问:我可以在Opentrons平台上使用什么样的实验设备?

答:开箱即用,OT-2可以支持任何标准,自动化兼容SBS足迹井板,加上广泛的盖和螺旋盖管高达50mL锥形与我们的4-in-1管架。您可以在我们的必威体育打水套利

问:你支持定制的实验器具吗?

答:OT-2可以和你现在使用的几乎任何一件实验用具一起使用,即使是定制的。

如果您需要使用与普通微孔板具有相同足迹的自定义实验室器皿,您可以使用我们的自定义实验室器皿在几分钟内创建自己的定义实验室的器具的创造者

如果您需要使用定制的实验室用具,没有相同的足迹作为一个普通的微孔板,我们的应用工程师可以为您创建一个。或者,如果你有一些编码知识,你可以自己创造一个和3D打印支架或适配器使用它在甲板上。

问:我需要知道如何编码使用Opentrons平台吗?

答:你不需要知道如何编码来使用Opentrons平台。协议可以使用Opentrons的即插即用协议设计工具创建。我们还有一个应用工程团队,帮助客户构建协议。

问:我能看一下协议样本吗?

答:我们所有的协议都是开源的,可以免费访问GitHub

问:OT-2到______需要多长时间?

A:分配20uL到一个板内所有96孔?

问:384孔板的所有孔加1uL ?

答:使用Opentrons单通道P20 GEN2电子移液管,最快设置为2分钟

问:装满1mL的管子?

答:7秒,使用Opentrons单通道P20 GEN2电子移液管

问:我可以用OT-2办理小额转账吗?

答:你可以精确地使用我们的Opentrons 8通道P20 GEN2电子移液管或Opentrons单通道P20 GEN2电子移液管来处理1-20µL的量。移液管在1µL的设定值进行校准和出厂测试,并附有校准证书。然而,即使有测试和认证,通过自动空气置换移液管来处理低量的传输也需要测试和优化以确保它们符合您的要求。

问:你能把粘性液体转移到机器人上吗?

答:一些客户使用OT-2来输送蜂蜜和血液等粘性液体。但是,由于OT-2使用的是空气置换移液技术,它不能优化粘性液体。机器人转移的体积将不同于你输入OT-2软件的体积,所以可能需要额外的优化(例如加热液体,旋转液体,使用宽孔尖端)。

问:我能在OT-2中创造一个干净的环境吗?

是的。当配备了我们的HEPA模块, OT-2外壳可以变成一个清洁的工作环境。然而,Opentrons电子移液器不能被高压灭菌,所以你需要使用滤嘴来防止移液器内部的污染。另外,OT-2不支持紫外线消毒。

问:我能用384孔板吗?

答:标准全围边384孔板与OT-2完全兼容。但是由于井的尺寸,我们建议在使用384孔板时只使用Opentrons单通道P20 GEN2电子移液管。使用像Opentrons 8通道P300 GEN2电子移液器这样体积较大的移液器会比较棘手,因为这些移液器的尖端直径较大,这使得进入384孔板的小孔所需的精确实验室仪器校准具有挑战性。

如果你需要温度控制你的384孔板,你需要找到一个铝热块标准SBS足迹与Opentrons温度模块一起使用。

问:我需要使用你的建议吗?

答:您必须使用optrons Tips来安装和校准您的optrons OT-2。

虽然可以在Opentrons移液器中使用任何通用孔头,但我们强烈建议您在Opentrons系统中使用Opentrons移液器,因为它们经过了专门设计和彻底测试,以确保与Opentrons电子移液器一起使用时的体积精度和精度。我们的建议是具有价格竞争力并预先内置到Opentrons软件中。

为了使用第三方提示,您需要一个自定义的实验器具定义,并且在许多情况下,需要一个3d打印适配器来将提示盒放入OT-2甲板槽中。

问:如何防止交叉污染?

答:OT-2有一些特殊的功能来管理从移液管的液滴形成,比如气隙,触摸提示,吹灭

你可以做的最重要的事情来防止污染是设置甲板和机器人的运动,以避免操纵肮脏的移液管在干净的样本。您可以通过可视化实验的甲板布局来确保这一点必威体育2021欧洲杯官网,或者使用Python指定机器人要遵循的XYZ路径。

您可能需要使用甲板上的储液器作为液体废物容器,以避免容易受污染的样本长时间移动。如果是这样,并且您需要帮助,我们的应用程序工程团队可以帮助您。

问:你能把样品从管到板或者反过来吗?(即管到96孔板和多个96孔板到384孔板)

答:您可以使用Opentrons平台重新格式化样本:唯一的限制是移液管体积。Opentrons 8通道GEN2电子移液管不能用于进入384孔板中的管或所有孔。为了使用Opentrons 8通道GEN2电子移液管对样品进行重新格式,您需要在下游分析中处理384孔板上每隔一个孔的访问,或者使用Opentrons单通道GEN2电子移液管。

下面是一个使用Opentrons 8通道GEN2电子移液管将4个96孔板合并到384孔板的例子:

问:什么类型的输入,Opentrons接受板重新格式化/挑选?

答:我们有一些针对不同类型输入的预构建协议我们的挑选方案可以使用CSV作为源和目标输入。如果您需要不同的协议,我们的应用程序工程团队可以为您定制一个。

问:你能与我的LIMS系统集成吗?

答:Opentrons目前不提供任何官方支持的LIMS集成。但是,如果您的LIMS可以输出CSV,那么我们的一些预构建协议可以接受该文件作为输入。如果您需要更多的定制,您可以随时要求我们的应用程序工程团队为您编写一个协议,接受您的LIMS格式的CSV作为输入。此外,自Opentrons API是完全开源的,如果您的团队中有人有编码能力,您可以用您的LIMS编写自己的双向集成,甚至远程运行协议。

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