Opentrons出版物和引文

在过去的四年里,科学家们在同行评议的出版物、预印品、会议论文、文章甚至他们的毕业论文项目中引用了Opentrons近36次,而这仅仅是个开始!这里有一些例子。

在Opentrons,我们开始为生命科学家制作机器人,所以他们可以更快,更可重复地进行研究。

它正在工作。

我们在过去四年中看到了近三十个引文,从科学家使用我们的平台,我们每天都在看到更多。生物学家,化学家和许多其他生活科学家在出版物,预印,会议论文,文章,甚至在研究生论文项目中都引用了Opentrons!我们很高兴成为这些项目的一部分,我们很激动到与你分享。

以下是Opentrons的一些引文:

我们将增加更多,因此继续检查此页面!___________________________________________________

新冠肺炎

纸质:基于高通量共轭的自动化应变应变施工

研究人员的一篇论文Jülich研究中心概述了使用OT-2作为基因工程工作流程的一部分的自动端到端分子生物学克隆程序。这里的一个摘录:

*使用两种不同的液体处理系统的决定是为了最有效地使用实验室设备的动机:只要有可能,OT-2用于执行单元操作。与更昂贵的EVO 200相比,这种保存的时间,因此可以用于更苛刻的实验......要使工作流程为可以访问,仅使用OT-2是有益的。

阅读ACS中的论文

纸质:评估SARS-COV-2检测的两种自动低成本RNA提取方案

研究人员的一篇论文医院大学大学拉巴斯详细说明SARS-COV-2测试中的高通量RNA提取的两种低成本自动化方案。这里的一个摘录:

*在10天内收集了141份SARS-CoV-2阳性样本。内部协议基于磁珠提取,设计用于Opentrons OT-2液体处理机器人或MagMAXTM Express-96系统。

阅读血清中的纸张

纸质:Robocov:RT-QPCR的SARS-COV-2测试是一个实惠的开源机器人平台

研究人员的一篇论文医院诊所De Barcelona展示RT-QPCR SARS-COV-2测试的自动可重复工作流程。这里的一个摘录:

由Opentrons开发的经济实惠的OT-2开源液体处理机器人的出现开启了低成本自动化解决方案的门。最初设想在研究实验室中进行简单的移液任务的站可以连接以产生更复杂的工作流程。

请阅读bioRxiv中的预印本

纸质:包含:用于自动化Covid-19诊断的开源运输容器实验室
一篇科学家的论文opencell Bio.伦敦国王大学详细说明如何根据标准的40英尺运输容器创建用于自动化RT-QPCR Covid-19测试的模块化生物安全等级2+实验室。这里的一个摘录:

我们已经为开源和低成本Opentrons OT-2液体处理器开发了用于RNA提取和QPCR板材的自动化协议......使用开源硬件和试剂允许实验室围绕有限供应链导航。OT-2液体处理机器人相对于其他液体处理机器人的初始成本低,可以利用在编码语言Python中写入的通用塑料软件和运行协议。

阅读Biorxiv上的预印

论文:利用开放硬件减轻COVID-19对全球卫生系统的负担
一份总结为COVID-19预防、治疗和诊断开发和部署的免费和开源的科学和医疗硬件的论文。该研究小组由苏塞克斯大学引用Covid-19监视测试系统的Opentrons开源硬件平台。这里的一个摘录:

…以Opentrons为例,一个开源实验室自动化平台,一直与BP基因组学和开放医学研究所合作,每天自动化多达2400例检测,并获得美国FDA EUA批准,目前正在巴塞罗那医院诊所的生物医学诊断中心(CBD)实现COVID-19检测自动化。

把报纸读进去公共科学图书馆生物学


微生物学

纸质:小鼠喂养obesogencic西方饮食,施用抗生素,并进行无菌外科手术,用多药抗性病例发展致命的败血症
一篇文章,描述了obesogensic西方饮食对手术后感染结果的影响。国际研究团队由此引领芝加哥大学使用了16S RRNA测序管道中的图书馆池的Opentrons。这里的一个摘录:

定量的结果用于将来自PCR产物的DNA的量标准化以用于测序,并确保在测序期间均匀地表示每个扩增子。然后使用运行自定义Python脚本的Opentrons液相处理程序顺序地将这些卷顺序整合到单个管中。

把报纸读进去MBIO.

纸质:催化大学生淘气的淘金沉淀细菌谱系的快速发现
研究人员的一篇论文北卡罗来纳州立大学描述跨学科计划,用于参与学生的遗传采样,鉴定和分析微生物,Delftia SPP.。这里的一个摘录:

液体处理程序可以是成本普通的,但不允许诸如OpenTrons OT-2等昂贵的型号,我们正在开发该仪器的脚本。

阅读peerj上的预印刷品


实验室自动化

纸质:自动化3D微细探测器促进3D细胞培养模型中的高含量和高度可重复的氧气测量
研究人员的一篇论文昆士兰理工大学详细介绍了一个全自动的显微物理测量装置,用于观察3D细胞培养模型。这里的一个摘录:

我们的数据表明,由于高度的自动化和位置精度,微观测量设置使得具有高度可再现的测量而不会进行人为干预。

把报纸读进去ACS

论文:生命科学研究实验室的自动化
来自研究人员的论文爱丁堡大学概述了学术实验室采用自动化工具来增加或取代手动任务以提高效率、节省时间和准确性的困难。这里的一个摘录:

中小型自动化公司通过与学术机构合作的赠款计划或外部风险资本资金,在创新开发实验室设备方面往往最成功。例子包括……OpenTrons(原文如此)。

阅读文章生物工程与生物技术前沿

文章:自动化实验室的DIY方法
一篇文章迈克五月描述如何使用opentrons等灵活的研究设备解决方案有助于生物学家节省时间和金钱,并赋予他们的定制增加。这里的一个摘录:

[研究人员]通过划痕的建筑工具恐吓可以采取中间地址并修改现有硬件。例如,Greenwald调整了OT-One,由纽约市的Opentrons制造的机器人移液系统,以自动化在细胞信号研究中的试剂加法和样品成像。

阅读文章自然

纸质:一种开源技术平台,可提高可铺设的明胶甲基丙烯酰基(Gelma)水凝胶的再现性和高通量生产
研究人员的一篇论文昆士兰理工大学描述了基于GELMA的3D构建体的高吞吐量生产开源全自动平台。这里的一个摘录:

一个开源移液机器人(OT-One S Hood, Opentrons, Inc., NY, USA)与改进的硬件和软件组件集成,以适应两个正位移移液器的操作。

把报纸读进去科学直接

论文:一个以自动化和标准化的方式制造基于水凝胶的三维文化模型的开源技术平台
研究人员的一篇论文昆士兰理工大学详细介绍了混合粘性材料的开源自动化协议。这里的一个摘录:

基于手动的工作流程限制了粘性材料的进步和广泛采用,例如用于生物医学应用的水凝胶。可以通过使用具有标准化混合过程的自动化工作流来克服这些挑战,以提高重现性。

在视频期刊中查看纸张j

论文:开放式工作站:一种用于自动化体外工作流的模块化开源技术
研究人员的一篇论文昆士兰理工大学概述装配线样式端以结束全自动实验室平台,包括可定制,开源,现成硬件。这里的一个摘录:

Opentrons API -一个Python框架被设计用来为移液模块(OT-1)编写协议脚本。

把报纸读进去科学直接

论文:用机器人液处理解锁基因组学实验室的效率
来自研究人员的论文Kwazulu-Natal大学描述基因组学实验室投资液体处理自动化的日益趋势,使高通量下一代测序(NGS)工作流程更有效和成本效益。这里的一个摘录:

开源编程机器人在是最灵活的液体处理系统。OpenTrons机器人在协议设计方面是完全模块化的,新协议或实验室可以轻松编码为多功能编程接口。

在BMC基因组学中阅读论文


合成生物学

预印:DNA-Bot:用于合成生物学的低成本,自动化DNA装配平台
预印本,研究人员伦敦帝国学院详细说明他们如何为各种合成生物学应用创建全自动DNA装配方法。这里的一个摘录:

自动化DNA组件使得使用更少的研究人员的时间来实现更大的构建,增加可访问的设计空间。然而,这些益处目前为设备和耗材产生了高成本。在这里,我们通过用基础on Opentrons(DNA-Bot)引入低成本DNA组装来解决这种限制。

阅读Biorxiv上的预印

文章:改进合成生物学的再现性
研究人员的一篇文章Novo Nordisk Biorystainability基础中心在丹麦描述了减轻合成生物学再现性问题的方法 - 并引用Opentrons作为建立未来的关键部分。这里的一个摘录:

Opentrons最近在Kickstarter上发起了一项活动,旨在满足低成本和灵活的液体处理器的需求。由此产生的OT-One机器人在学术界和工业界都很受欢迎,这使得Opentrons能够在实验室自动化领域建立自己的地位。

阅读文章Bionengineing和Biotechnology的边疆

论文:自动液滴微流体快速生产和回收细胞球体
瑞典研究人员的预印刷品SciLifeLab描述如何使用一个Opentrons液体处理机器人流线型加载微流体。这里的一个摘录:

作为连续相,使用了含1% PEG-PFPE两亲性嵌段共聚物表面活性剂(Ran Biotechnologies)的氢氟醚(HFE, 3M™Novec™7500工程液)。在移液机器人(Opentrons OT-One-S Hood)的帮助下,向连续相储层中加入1ml HFE和1%的表面活性剂。这就启动了微通道,限制了微流体通道网络内捕获的空气量的最小值。

阅读SLA技术中的论文或者ncbi摘要

面向重组酶状态机遗传电路组装和测试的柔性自动化平台
来自波士顿大学的海报潮湿的实验室详细说明如何通过自动化创建更好,易于使用,可伸缩的重组酶状态机(RSM)遗传电路。这里的一个摘录:

我们的标准化RSM装配管道探讨了利用OT-2(Opentrons)低成本液体处理机器人的Gibson(综合基因组)和基本(Imperial Collect-Ref)方法。

在线查看海报


Genetics&Gene编辑

预印迹:旨在妨碍进化的合成遗传码
预印本,研究人员斯坦福大学描述蛋白质编码序列点突变的创建和测试大肠杆菌。这里的一个摘录:

我们通过体外实验表明,减少的21个TRNA能够表达其编码序列被重新编码以使用故障安全码的蛋白质,而没有表示标准码编码。

阅读Biorxiv上的预印

预印迹:疟原虫:疟疾自动化文化的开源平台
来自研究人员的预印刷品桑格研究所描述一个廉价的开源实验室自动化系统自动化疟疾寄生虫培养。这里的一个摘录:

仅仅是寄生虫的概念,以及维持两种不同培养成分,血液和培养基的正确比例,对寄生虫学是独一无二的,因此在商业系统中可能难以实现,这些商业系统并非用于这种相对利基目的。潜在的解决方案是Opentrons系统,比任何其他液体处理系统更便宜,也非常灵活,这意味着它可能适应疟原虫培养的独特要求。

阅读Biorxiv上的预印

纸质:FUSX:用于基因组科学的快速单步转录激活效应器组装系统
来自研究人员的论文梅奥诊所描述了一种名为FUSX的新型,低成本,自动化和简化和简化的金门故事组件系统,以及其在斑马鱼基因编辑中的应用。这里的一个摘录:

我们展示了FusX系统可以很容易地使用实验室自动化工具,即OpenTrons液体处理机器人,使该协议在硅TALEN设计工具中快速扩展。

把报纸读进去人类基因治疗


蛋白质组学

纸质:用于低输入蛋白质组分析的全自动样品处理和分析工作流程

来自研究人员的论文布莱姆杨大学描述了仅使用商业上可获得的仪器处理和分析蛋白质分析的全自动平台。这里的一个摘录:

在当今市场上可用的许多自动液体处理系统中,OT-2特别有吸引力,因为它的价格低(目前,5000美元加上配件成本),这应该可以访问许多实验室。

把报纸读进去分析化学


内分泌学

纸质:用机器人适体的电化学读卡器测量黄色素激素脉搏
来自研究人员的论文香港大学描述一种新的自动化激素激素脉动,用于快速临床诊断生殖障碍的临床抑制方法。这里的一个摘录:

我们报告了机器人适体的电化学读取器(REDER)电化学分析系统的开发和应用,以确定旋光激素脉动性。

把报纸读进去自然通讯


论文

论文:Robot-Trifle:一种用于自动组合生长表型的机器人系统
杰里米·金博尔的硕士论文伊利诺伊大学描述流线型,自动分析管道以产生微生物生长表型。这里的一个摘录:

该项目Robot-Trifle是一种分析管道,用于简化最小化学定义的培养基的自动结构,用于熟悉培养物中生长的微生物。[...]该项目用于该项目的机器人本身是Opentrons可获得的开放式硬件AutopIpettor [SIC]。

读杰里米的论文


同样,这些只是使用了一些途径的样本。我们已经知道我们社区正在努力的一些真正令人兴奋的研究,所以保持调整!我们将在公共场合分享那些人。

我们会定期更新这个列表。请过来看看!

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