opentron如何在2019年iGEM上促进合作和创新

来自世界各地的生物学和工程学生聚集在波士顿的IGEM基金会竞争中,展示了综合生物学的力量和能力在大型方面 - Opentrons的帮助。

在万圣节,国际基因工程机器(IGEM.)基金会在马萨诸塞州的波士顿举办了一年一度的学生合成生物学竞赛。来自世界各地的生物学和工程学学生聚集在一起,展示他们已经进行了数月的项目,以展示合成生物学的力量和能力,对他们的社区和整个世界产生持久的社会影响。

Opentrons价值观的使命和承诺 - 这么多连续一年我们提供了10个iGEM小组OT-2移液机器人以及使用我们其他的开源工具。从亚热带气候下的水净化项目,到从海洋生物中创造新的生物材料,来自全球各地的学生团队共同努力推进合成生物学。

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协作是关键:一起工作以重现结果
每一个iGEM 2019项目都是一个协作努力,要求团队为了科学进步在自己的舒适区之外工作。这是一次独特的、令人难以置信的学习经历——它带来了奇妙的结果。

最雄心勃勃的项目之一由此诞生加州大学戴维斯分校。使用来自IGEM标准分配试剂盒的荧光素染料和微球,UC Davis团队设计了一种串行稀释协议,可以手动运行和OT-2。然后,他们将此协议与七所其他学校共享,并要求他们报告每个版本的结果。

“这是测试OT-2精度的好方法,”朱迪·​​雅各布,UC戴维斯团队成员遗传学和基因组学生表示。通过征求外面的反馈,UC Davis能够衡量OT-2对其他学校的表现的经验,为他们的结果提供更好的标题,同时创造了恰好的跨学科协作IGEM茁壮成长。另外,鉴于从其他团队收到的结果的一致性,“机器人非常好,”根据雅各布,“我们真的很喜欢它。”所以她告诉我们“我们实际上在我们的实验室空间中教授一个新的团队,以便为ELISA测定使用OT-2。”这支新团队由年轻科学家组成,年轻科学家没有有很多脱船体验,使得液滴机器人喜欢OT-2欢迎加入实验室。“他们真的很兴奋,”雅各布说。“拥有Opentrons机器人真的很棒。”

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增长思维:将挫折转变为机遇
其他团队学习了有关执行实验的有价值的教训,包括超出实验协议的因素。瓜达拉哈拉大学例如,他发现了倡导的重要性。他们的学术机构以前从未参加过iGEM,所以为了让他们这样做,他们必须向关键利益相关者展示他们项目的重要性,以获得资金和导师——没有这些,他们将无法参与。

一旦他们获得了这些基础支持,ITESO团队就开始了他们的项目:用蓝藻细菌清洁微咸水,以减少二氧化碳的释放,并有望减缓气候变化。这是一个雄心勃勃的项目,虽然他们不能让尽可能多的进步——因而无法完全OT-2集成到他们的实验室设置团队与全球同行仍建立强大的债券,并启发继续倡导改变在他们的社区。

这种精神是IGEM的全部。

莱顿大学也能够团结在一起并解决挫折。每天早上,团队聚集在一起讨论和分配日常任务,以及回顾前一天的挑战。Lieden团队的项目专注于从吸入剂中创造新的生物材料来治疗烧伤患者,这让他们认识到,设定现实的期望和努力实现鼓舞人心的愿景同样重要。莱顿小组的科学经理乔-安妮·弗舍尔解释了过度自信是如何挫败了他们克隆项目的努力的。Lieden没有使用他们的iGEM分发包中推荐的质粒,而是选择了他们自己的质粒,因为“iGEM质粒非常适合克隆,但不适合生产。”研究小组努力了几周都没有成功,然后又回到了最初的质粒上,质粒立即起了作用。这花费了大量的时间和故障排除,使得莱顿团队几乎没有空间来围绕自动化重新设计他们的实验。然而,他们确实成功地参与了加州大学戴维斯分校的协作测量项目。

庆祝iGEM成功
在opentron赞助的10支队伍中,有7支获得了奖牌或田径奖项,以表彰他们的出色工作:

金牌得主:

  • 海洋大学
  • 莱斯布里奇大学

银牌获得者:

  • 纽约大学
  • 加州大学戴维斯分校
  • 莱顿大学

特殊奖励:

  • 最佳制造项目跟踪奖(Overgrad) -莱顿大学
  • 最佳基础进步(本科)-新加坡国立大学
  • 新加坡最佳零件收藏(本科) - 新加坡大学
  • 最佳基础推进项目赛道奖励(弗洛克特) - 工程大学

我们为他们感到非常自豪,同时也为我们所有团队的项目规模感到自豪:

  • 开罗大学旨在开发可持续的微生物和无细胞脱盐系统的谁,以帮助埃及的人口生长饮用水。
  • 惠灵顿维多利亚大学世卫组织希望通过工程大肠杆菌来过表达酶并改善其功能,从而创造一种高效、安全、可持续的酶燃料电池。
  • 海洋大学他致力于创造模块化的核糖开关,使基因表达在工程系统中更容易调整和调控。
  • 莱顿大学谁想从大肠杆菌中表达来自Humboldt鱿鱼的苏素蛋白,并用它们来创造多功能,灵活和强大的新生物材料。
  • 耶稣会德瓜达拉哈拉大学谁希望改善蓝藻的光合活性,目的是提高它们对大气碳的能力并产生经济上有价值的代谢中间体。
  • 莱斯布里奇大学旨在开发一种可生产的重组胰岛素的藻类菌株,其可以口服脱水和消耗。这可以提供可行性,低成本和易于使用的替代现有的胰岛素制造和递送方法。
  • 加州大学戴维斯分校谁计划扩大哺乳动物合成生物学的基础工具,通过彻底研究和表征IGEM分配试剂盒中的现有启动子,并通过添加新的零件来实现哺乳动物系统的有效工程。
  • 代尔夫特理工大学世卫组织将重点放在了设计一种新的体内正交复制和转录平台上,该平台可在多种细菌物种中实现更有效的定向进化。
  • 新加坡国立大学谁希望扩展大肠杆菌的生产寿命,以提高其在工程蛋白质生物制造中的有效性。

在Opentrons研讨会上体现IGEM的精神
Opentrons还在iGEM的大型大会上举办了一个实践研讨会。战略计划总监Kristin Ellis和高级软件经理Toma Morris带领参与者演示了Opentrons的OT-2液体处理机器人的灵活性和可定制性。在解释了OT-2的开源编程选项并介绍了其他突出的功能(如新的温度计)之后,ellis为参与者提供了一个动手做开源项目的机会:使用Opentrons的定制盘子艺术必威体育2021欧洲杯官网。埃利斯要求有电脑的与会者举手,结果有九个人举手;学生们分成小组,通过协议设计师学习如何设计自动协议,并创建定制的盘子艺术,他们可以在当天必威体育2021欧洲杯官网晚些时候在Opentrons展位上提取。

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继续激励
我们感谢这些团队和IGEM基金会,他激励我们继续我们的工作,为生物学家创造低成本实验室自动化解决方案。通过支持合成生物学及其具有可访问技术的新兴领导者,我们正在赋予下一代科学家合作,创新和推进生物学的前沿。我们期待着看到所有这些学生在接下来完成的事情!

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所有照片归功于Igem Foundation和Jacob Knight。