自动化如何帮助确保高质量的DNA

高质量的DNA是许多生命科学应用的关键。自动化可以帮助确保它。这是如何。

从基础研究到临床诊断和药物发现,下一代测序(NGS)和qPCR应用主导了当今生命科学的许多领域。这些应用程序是高度敏感的,需要科学家从高质量的DNA开始,以获得可靠和有意义的数据。

虽然没有正式的标准来定义什么是好的DNA,但人们普遍认为它是高完整性、无杂质和适合于手边应用的浓度。

好的DNA具有完整性

完整性是指DNA样本的整体完整性,考虑了降解和剪切。您的应用程序将确定样品中的DNA片段需要多大和完整,您应该相应地优化您的分离方法。例如,如果分离基因组DNA进行PCR克隆,通常可以避免某种程度的片段化和降解。然而,对于需要高分子量DNA(如长读序列)的定量应用程序和工作流程,您应该以尽可能高完整性的DNA为目标。

DNA样本的整体完整性很容易受到剪切的影响,剪切可能发生在过度涡流,甚至在手动移液时施加过大的力。自动化通过提供对混合速度和重复的一致控制来消除这种危险。这确保了样本大小和结果的一致性和可靠性,并减少了用户错误的机会。

好的DNA是纯净的

理想情况下,你的DNA样本应该只包含洗脱液或存储缓冲液中的DNA。一个常见的杂质来源是从DNA分离和纯化过程中带入的,如有机溶剂和盐。根据样品类型的不同,存在于原始样品中的其他物质,如微生物和植物代谢物、色素和细胞壁成分以及其他杂质,可能会在分离和纯化过程中幸存下来。其中任何一个都可能干扰甚至抑制工作流中的下游步骤,因此应该删除。

因为自动化使用磁珠来获得样品纯度,而不是手工过程,它可以更有效。当添加到样品中时,这些珠子会吸引并粘合不需要的材料。然后,一个磁铁将珠子固定在管子的底部,将珠子和不需要的粒子吸引到下面,而剩余的样品可以被清洗,为下一步工作做好准备。这里有一个例子一种核酸纯化方案Opentrons协议库

好的DNA有适当的浓度

虽然DNA浓度本身并不总是质量的直接度量——低生物量样品不可避免地在低浓度下产生DNA——但精确测量DNA浓度的能力是大多数应用程序质量控制过程的关键部分,特别是在进行定量分析的地方,或者下游的工作流程如微生物克隆或NGS需要特定的DNA浓度。

如果你想讨论自动化如何帮助你的DNA纯化工作流程,我们很乐意通过免费电话咨询帮助你完成。