2017年Synbiobeta的Opentrons

这是Kristin Ellis在2017年Synbiobeta伦敦谈话的一份表称.在Opentrons,我们为生物学家制作了机器人。我们的5,000美元的个人吸液机器人是一种实惠且协作的自动化平台。我们拥有一部令人惊叹的用户,开发了新的软件集成,硬件工具,试剂盒,

这是Kristin Ellis在2017年Synbiobeta伦敦谈话的成绩单。

opentrons.

在Opentrons,我们为生物学家制作机器人。

我们的5,000美元的个人吸液机器人是一种实惠且协作的自动化平台。我们有一个惊人开发了新的软件集成、硬件工具、试剂包和协议的用户社区,这些都是开放源代码的,任何人都可以使用。

我们都知道生物技术是最强大,最快的技术部门,它使我们能够比以往任何时候都能建立更复杂的生物工具。但是,我们的生物工具和我们的实验室工具通常仍然存在差距。

一方面,我们从零开始构建生物体,打印合成DNA。另一方面,科学家们仍在使用上世纪50年代获得专利的技术来做任何事情。

当然,移液器仍然工作,但是当我们用手做重复的任务时,我们不会尽最佳关于我们的最佳事情 - 我们的大脑。

说到大脑,古老的格言“两个头比一个人好”永远不会比它在生物学世界中更真实或明显。我们需要像既可访问的opEntrons等工具让人们真正利用新的生物技术。

在座的许多人都以提问和寻求答案为生。在Opentrons,我们问自己:

当你为科学家提供廉价、灵活、开源的自动化工具和智能实验室模块时会发生什么?在实验室里有个人机器人是什么样子的?

我们开始看到这个问题的答案正在以一种不可思议的,有时甚至是有趣的方式成形。

那是我最喜欢的片段之一。它是丹麦奥胡斯大学的学生寄给我们的。目前,我们在50个国家有超过1000个机器人在各个科学层面努力工作,从著名的学术机构(如斯坦福大学、哈佛大学和麻省理工学院),到充满活力的生物科技初创公司(包括在座的一些公司),再到大型制药公司、加速器、孵化器和社区黑客空间。

在我接下来的演讲中,我将着重于几个来自我们用户社区的特定故事,这些故事说明了我们的机器人是如何在生物技术领域掀起合作和创新的下一波浪潮的。

我是马萨诸塞大学医学院阿米尔·米切尔实验室的蒂芙尼。他们正在研究细胞在动态变化环境中的调控,以更好地模拟健康和疾病的真实环境。虽然我们对细胞信号传导途径的特定快照了解很多,但我们对它们随着时间的推移如何表现的了解却很少——比如,对改变治疗或疾病状态的反应。

那些与需要多次敏感测量的实验合作的人知道剂量疼痛,每30分钟每30分钟服用细胞的快照。像这样的实验更好地启用并通过自动化执行,这就是我们能够帮助的地方。

Mitchell Lab使用我们的开源平台和自己的原型设计和工程聪明才智创建了一套智能模块,以帮助他们映射生物电路的时间依赖行为。

它们集成了DIY Cellmeter,LED Optimetics模块,更不仅要研究现有网络,还可以将它们与它们在实验室中设计和构建的替代电路进行比较,使用合成生物学的工具。

这些有用的硬件模块可以在短短几周内被设计、原型化、测试并无缝集成到Opentrons平台和API中——整个自动化系统的成本低于一个热循环器。

现在,你可能会思考,“这真的很实惠,很酷,但是那些无法访问指定的实验室工程师和制造商的普通用户?”

这就是伊莱恩这样的人所处的位置。

幻灯片:Elaine在Biomarin.jpg

Elaine是在生物罗素药业的药物发现研究中工作的科学家。她是一个生物资深人士,他们在过去十年的液体化和工作中占据了蛋白质生物化学,是指她的OT-One Pro作为她的个人实验室助理。她主要使用它来在大肠杆菌蛋白分数上运行夸张的测定,释放她的时间阅读纸张和设计更好的下游实验。

这不是一开始就是她最熟悉的事情。Elaine总是丢失了自己的实验,并且从未想象有权访问像Opentrons这样的工具。她在编程,原型设计或自动化方面没有背景,虽然我们开始为她编程她的工作流程,但她现在正在编写自己的实验。她甚至相信她的部门购买3D打印机,并为自己的移液器设计安装。

最重要的是,对于Elaine自己,她开发了一种自动化Bradford测定的协议,她每天运行,并科学验证它。您可以看到她使用她的机器人产生的这个标准曲线 - 它很简单,但它只代表了许多数据集。

最棒的是,她的工作让整个opentron社区受益。她的工作流程现在在我们的协议库中,任何人都可以使用它。它就像下载协议,加载你的平台,点击运行一样简单。

这是对经济适用自动化的开放权限的力量 - 它使人们喜欢Elaine从0的自动化知识到贡献社区。

我们刚发表了一个关于伊莲的故事在我们的博客www.richardlipsey.com上,所以如果你想了解更多,请去看看!

不幸的是,我没有时间来谈论我们所有优秀的社区合作伙伴,如DFCI, Twist Bioscience,以及无数其他的,所以我想强调的只是另一个小组,他们正在我们的平台上建立新的能力。

花几秒钟来看看这个视频。

这是斯坦福大学德鲁·恩迪实验室的研究生安东·杰克逊-史密斯(Anton Jackson-Smith)在一个下午做出的原型。这就是开源平台的力量。任何具有一定编程技能的人都可以构建任何他们梦想的新功能——包括用语音命令告诉他们的个人实验室机器人做他们的工作。

科学的进步与人们创造更好的发现工具是不可逆转的联系在一起的,而我们热衷于提供这些工具。

我今天向你们展示的还只是一个开始。每天都有越来越多像伊莱恩这样的生物学家开始使用opentron,学习自动化的基础知识,以节省自己数小时的移液时间。像阿米尔和安东这样的生物工程师正在制造令人难以置信的产品来满足他们社区的特殊需求。

Opentron的使命是将这些实验室联系起来并与想要他们的人分享这些社区驱动的发展。我们有能力促进和实现这一社区的积极科学素养和合作一直梦想。

花一分钟问问你自己——你可以在你的实验室里自动化什么?你会如何利用每周不用移液的额外时间?你想和谁一起工作?你想和synbio社区的其他人分享什么?如果你想听我们其他197个用户故事中的一个,或者谈论如何使用opentron自动化你的工作流程,来找我吧!谢谢你!