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文档的主题:

实验室自动化

摘录:让我们考虑一下什么是好的自动化工作流,什么不是。关键的一般概念可以应用于几乎任何协议。开始,查看“图3:您的工作流是自动化的一个很好的候选者,如果……下表,并将其与您正在考虑的液体处理自动化流程进行比较。如果表中的所有5个特性都适用于您的实验室中的一个通用工作流,那么您应该自动化它!如果其中一些方法不适用于您正在考虑的工作流程,那么坚持手动移液可能是最实际的方法。让我们更详细地考虑一下这些特性。首先,你应该寻求一个自动化的解决方案,它可以很容易地适应你在工作流程中经常使用的液体量……

摘录场景:一位主要研究人员计划扩大她的学术实验室的研究人员数量,但由于可能不会使用液体处理器,她正在犹豫是否购买液体处理器。事实:大多数实验室设备大部分时间都闲置着。但这不是任何一个液体处理器的错;这通常只是行业的本质。在使用这些工具的实验室中,有多达25%的实验室从事需要时间激活的高度复杂的项目,而实验室可能没有时间设置这些工具。此外,一些自动化解决方案只设置为一种协议,这使得在实验室需要时切换应用程序变得困难,甚至不可能。其他工具非常复杂,只有一两个实验室成员有使用它们的专业知识,导致所有的实验室成员依赖这些少数人来保持工具的运行。而且,坦率地说,有些工作流程就是不能自动化……

摘录由于它的多功能性和多种多样的应用,生命科学家可以从开源中获得一系列的好处。举个例子,开放源代码可以使湿实验室设备的特性针对特定的检测进行微调,甚至可以大规模修改以创建全新的特性,比如将液体处理器变成蜂群采集器。加州大学圣地亚哥分校的成像专家埃里克·格林沃尔德就是这么做的:他在自己的另一个基座上开了一个孔,加上腿,然后把它安装在倒置显微镜上。格林沃尔德利用这种结合了荧光传感器的液体处理成像系统来研究药物如何影响活细胞中的生化信号。另一个例子是自定义设备的操作。只需几件高精度3d打印零件,一个齿轮系统和一些螺钉,大多数科学家都可以制作一个抓取装置。格林沃尔德就是这么做的,建筑一种用于移动培养皿的抓取装置在他的另一个甲板上……

文档的应用程序:

总会在图书馆准备

摘录:当使用自动化来创建NGS库时,科学家们可以从节省的资源中受益。例如,在手工准备一个图书馆时,新技术人员必须接受数天的培训,包括培训、试剂和时间,这可能会花费实验室数万美元。另外,手工准备一个NGS库需要花费很多时间。一个有经验的技术人员在三天内可能会准备8个图书馆。另一方面,实际上,几乎不需要人手,一个自动化的NGS准备工具包在一天内就能完成24个库。这意味着,在一周5天的工作时间里,一名技术人员可以用手工方法准备大约13个图书馆,或者用低成本的自动化方法准备120个图书馆。因此,即使在仅仅一周的时间里,产量的增加也确实带来了变化……

摘录从整合一个温度循环器中获得最大收益的方案是复杂的,在孵育或PCR步骤之前和之后都涉及多个子方案。让我们以下一代测序(NGS)库准备协议为例。在工作流程中,只需自动化移液和磁珠处理步骤,您就可以完成大约⅔的工作。这是酶的准备(碎片+ a-尾等),清理,索引,和汇集步骤,可以由an完成OT-2液体搬运机器人Opentrons磁betway必威官网登陆下载模块。如果你的机器人甲板上没有一个温度循环器,一个人(或者另一个更昂贵的机器人)必须将准备好的反应移动到温度循环器中。放大完成后,他们还需要从物理上取回样本——把它们从温度计上拿下来,放在机器人上进行最后的磁性和移液步骤……

NGS库准备工作流程故障与自动温度计
NGS库准备工作流程故障与自动温度计

核酸提取

摘录: 1)精简的提取流程。精确和一致的移液与自动化协议有助于实现在关键样品处理步骤的均匀性,如裂解,洗涤和洗脱。2)操作少,污染少。更少的人工处理和移液步骤减少了外部污染的威胁和样品携带的风险,无论该方案是否在无菌工作环境中执行。3)吞吐量和范围。通过自动核酸提取,您可以以更快的速度处理更大的样本数,从而增加您的吞吐量。这也为你拓宽研究范围创造了机会。

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