Opentrons用户访谈草原诊断服务公司动物卫生实验室Anatoliy Trokhymchuk和Mengying Liu

Anatoliy Trokhymchuk和Mengying Liu进行了质谱应用,包括用Opentrons OT-2制备MALDI-TOF质谱靶。这是如何。

Anatoliy Trokhymchuk首席科学官是干什么的Prairie Diagnostic Services Inc.(PDS),一个与之相关的区域动物健康实验室萨斯喀彻温省大学Mengying刘是PDS的自动化研究员,负责流程改进和自动化工作流开发。其中一个例子是质谱的应用,包括MALDI-TOF质谱靶制备使用Opentrons OT-2液体处理机器人。这是如何。

PDS实验室的一部分。信用:PDS.
PDS兽医实验室综合大楼的一部分。来源:黛博拉•马歇尔。

Opentrons:告诉我们你的背景。

Mengying刘:我是一个在PDS工作的研究员。我收到了中国农业大学的DVM学位,来到萨斯喀彻温大学,以获得兽医病理学的硕士学位。我开始在1月底前往PDS。我对计算机编程感兴趣,并将其与实验室测定相结合,我正在享受PDS的学习。

奥本tron:你们从事什么样的研究工作?

Anatoliy Trokhymchuk:我是一个为区域诊断实验室工作的兽医,处理各种客户和目标。一些目标,如监控测试和疫情响应,需要真正的规模测试。我们在PDS中有一群很好的人,而且我的工作是啦啦队,并确保他们拥有他们所需的所有工具。

奥本聪:你为什么选择OT-2?

Anatoliy Trokhymchuk随着工作量的增加和诊断方法的改变,我们需要更多、更精确地在实验室中完成常规、重复的任务,我们意识到自动化是未来的发展方向。我们的实验室已经有了很多不同种类的机器人,而且我们正在快速学习OT-2。在不久的将来,将会有更多基于基因组学的快速诊断技术出现,自动化是其中很大的一部分。

我认为实验室中人类的主要目标是探索科学的边缘,看看我们可以做些什么创新。- 梦营刘

OpenTrons:您使用OT-2做了什么,以及它如何适合您的工作流程?

Anatoliy Trokhymchuk:答案有两个部分:一个是孟英正在使用的协议,另一个是使用OT-2作为学习工具。我们正在学习如何优化协议和工作负载来扩展我们的业务。我们真的很喜欢OT-2作为一个工具,但我们更喜欢在更大的背景下使用它:我们如何将更大的任务自动化并将其集成到我们的工作流程中?

奥本龙:你在实验室里一天的工作是什么?你用什么化验法?

Mengying刘我从事不同实验室测试的自动化工作,一个例子是MALDI目标涂层。我们的系统使用的是96点目标,与制造商无关。我在实验室使用OT-2液体处理机器人为应用程序创建了一个工作流和协议。

在我们进行OT-2之前,在将细菌中取样到目标上后,技术人员必须用手移液到井96次上,这很容易被机器人更换。此外,因为我们是一个诊断实验室,我们必须确保没有样品污染,所以技术人员每次都必须改变移液器尖端。OT-2可以精确地处理移液至0.1mm,这使我们能够在不触摸井中的样品的情况下分配矩阵 - 我们只需要8个整个目标的提示,减少塑料废物。

实验室不是一个让人整天拿着吸管苦干的地方,而是一个让人富有创造力和生产力的地方。苏维埃-格Trokhymchuk

而且,所设计的协议易于建立。这就是我们使用OT-2的原因熟练的技术人员可以在5分钟内手动移液,但OT-2也差不多能这么快完成。但好处是不需要高技能的技术,而是让技术有时间做其他事情。我们正在整个实验室努力使其标准化。

使用Opentrons API和一个定制接口,我将机器人与我们的LIMS系统连接起来,生成一个显示控件和样本位置的车牌地图,我可以将其导出为纯文本文件,并作为我的协议上传。它可以节省很多时间,并在实验室中轻松集成。与OT-2很容易做到,因为我只需要在开始时校准机器人一次,每次最多可以做8个板块。我正在探索OT-2的其他应用程序,也可以更轻松地制作其他实验室工作。

PDS的MALDI板OT-2甲板设置。来源:Mengying刘。
PDS的MALDI板OT-2甲板设置。来源:Mengying刘。

OT-2具有不同集成的潜力,所以当我完成MALDI工作流时,我将把它用于其他工作流。

Opentrons:大流行前的正常日常生活是什么?

Anatoliy Trokhymchuk:在大流行之前,我们的日常生活完全一样。但在大流行期间,我们在实验室必须戴口罩,并遵守公共卫生部门规定的所有预防措施。我们被认为是重要的服务机构,我们的功能和工作没有改变,即使有一段短暂的紧张时刻,我们不知道加拿大西部的疫情会有多严重,也不知道我们的实验室是否会被要求帮助应对。我们没有直接参与大流行应对工作,但我们在魁北克的同行参与了,他们的动物卫生实验室被重新用于COVID-19检测。

奥创:你们还计划其他的自动化吗?

Anatoliy Trokhymchuk:我想在我们的实验室中看到所有的自动化工具无缝工作,给机器人的Mundane实验室任务,人类提供监督,控制和开发应用程序。实验室不是一整天在吸移管的地方,但要富有成效和创造力。

梦营刘:这将是未来,我真的很想看到!我相信有一天,所有这些重复的工作都将被自动化所取代。我认为实验室中人类的主要目标是探索科学的边缘,看看我们可以做些什么创新。没有涉及重复的工作,但更实验的事情。

Opentrons:你还有什么想用OT-2说的吗?

Anatoliy Trokhymchuk:关于工作流设计还有很多需要学习的地方,而不仅仅是自动化。这是一个渐进的过程。我们是一步一步地学习,先瞄准主要任务。最终,把整个工作流程交给机器人平台是很好的,但我认为我们离那还有很长的路要走。尽管如此,由于平台的灵活性和本质,自动化为我们提供了这样做的机会。

梦营刘:我真的很喜欢OT-2的灵活性。有一些公司只为MALDI设计机器,但是我们可以在OT-2上做很多不同的协议。

PDS'标准化麦克风板准备设置在OT-2甲板上。来源:Mengying刘。
PDS'标准化麦克风板准备设置在OT-2甲板上。来源:Mengying刘。

标题照片学分:萨斯喀彻温政府