应用程序

DNA自动清理

概述

核酸清除是从酶反应中纯化特定核酸的过程,或创造一种悬浮液——一种悬浮在液体中的细颗粒混合物。核酸清理是许多分子生物学工作流程的关键步骤,包括NGS库的准备。使用这里概述的工作流程,科学家们可以增加他们的吞吐量,减少错误,并通过自动化他们的清理工作,每周节省几个小时的重复工作。


在Opentrons,我们建议使用欧米茄Bio-tek全纯NGS磁珠 这些协议。这些珠子可以为后续的工作步骤净化并选择特定大小的片段。更重要的是,我们在实验室展示了我们的液体处理机器人(OT-2)使用欧米茄Bio-Tek全纯NGS珠进行清洗时,可以生产出高产量和高质量的产品 (点击链接阅读我们的申请说明)。通过使用这些珠子并激活OT-2betway必威官网登陆下载,所选的核酸附着在磁珠上,并成颗粒状附着在磁珠孔的一侧。再悬浮分离后,可回收含纯化产物的上清液的OT-2 或者用于你的下一个实验。


此外,我们有一个协议,任何人都可以自定义,下载,并运行在他们自己的OT-2。我们也有一个工具来建立一个协议,将适用于任何品牌的磁珠,让科学家能够在他们的实验中改变所有关键参数,并使用我们的磁模块作为起点来优化净化。betway必威官网登陆下载

此工作流可用于以下应用程序:

  • PCR产物纯化
  • 门店库清理
  • 其他核酸清除

好处

自动化核酸清理比传统的手工协议有很多好处,例如:

  • 使单调、耗时的清理工作自动化这样你就不用做了
  • 减少误差和污染通过减少人为干预
  • 将复杂的工作流程串在一起需要清理,如NGS图书馆准备
  • 减少安装时间利用预先优化和验证的协议+试剂包

工作流

一步1

选择您的协议

从头开始使用协议设计器,或者使用协议库模板必威体育2021欧洲杯官网

一步2

将试剂放到机器人上

把预先准备好的PCR主混合在机器人上-或让OT-2为你做它。将主混合液与正向和反向引物混合。

一步3.

校准和激活协议

确认移液位置并点击“运行”(时间< 5分钟)

一步4

加载机器人并运行

在OT-2准备好所有反应后,运行PCR机器

一步5

收集纯化样品

收集干净的核酸,继续你的实验

笔记

试剂

这种应用已经在我们的实验室与试剂合作伙伴欧米茄Bio-Tek进行了充分的测试和科学验证。我们建议您使用欧米茄Bio-Tek全纯NGS。如果您想使用其他试剂盒,OT-2支持各种核酸提取试剂盒。当你收到你的特定试剂盒时,请确认你已经有了所需的试剂。

实验室的器具

OT2支持多种核酸提取实验装置。我们支持完全围合的0.02 ml PCR板,这是最适合模块本身。我们也可以支持多达2毫升深孔板,这可能有助于更大的容量套件。我们建议您在我们的软件中找到一个与您实验室中的实验室软件紧密匹配的实验室软件定义。或者,你也可以使用“实验室软件”。create '命令输入PCR板的准确尺寸。你可以在我们的OT-2上找到更多关于支持和自定义实验的细节必威体育打水套利

吸量管

确保你的OT-2配备了适合你需要使用的量的移液器。我们所有的移液管都可以支持这些协议,但移液管的大小可以根据洗涤的大小和使用的协议而变化。例如,如果你要进行600毫升的洗涤,你可能需要p1000吸管,这取决于你的规程。请检查我们的OT-2移液管白纸 更多信息请访问我们的移液管和移液量低至1µL(1)。

我们的社区

探索其他实验室如何使用OT-2实现自动化
预算科学

“我这辈子已经做了不知道多少次小准备了。我不想再做3000个了。”

尼克金刚砂

波士顿大学的潮湿实验室

黑客的灵活性

“我们选择opentron有两个原因:一是价格实惠,二是我们可以为它开发开源软件。”

Keoni Gandall

免费的基因工程

样品管理

“有时候,我们让Opentrons转移了800个样品。我不可能手工做那么多样品。”

Kaja沃斯克

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