已验证的工作站应用程序

自动NGS图书馆准备工作站

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自动NGS图书馆准备工作站

在一个自动运行中从样本DNA到准备序列库。


自动NGS库准备工作站包括OT-2实验室机器人、实验室设备和消耗品。

完整的工作站

19,440美元

订单工作站

消耗品

$ 29 /样品

订购消耗品

概述

下一代测序(NGS)是许多真生科学领域的基础,但准备用于测序的样品是一种艰苦的细致过程。OpenTrons自动化NGS库的机器人和高质量试剂伴随着验证的协议,几乎任何实验室都可以启动自动化NGS图书馆准备结束到底。

将样品放在OT-2实验室机器人上后,它将使用温度模块进行酶制剂,结扎和建立扩增以保持试剂冷却。然后,它将使用自动的On-Deck ThermoCyCler模块运行PCR步骤并在磁模块上执行基于珠子的清理。betway必威官网登陆下载

此OpenTrons Workstation包括您需要在实验室中启动自动化NGS Library Prep的所有内容;具有热循环模块的OT-2机器人,温度模块,磁模块,实验室,SWIFT Bioscience Lablet Prep套件和Obetway必威官网登陆下载mega Bio-Tek磁珠。

此工作站可用于下列用途:

  • 全基因组测序(WGS)
  • DNA测序
  • 宏基因组测序
  • 远程PCR扩增子
  • RNA-SEQ以全长,双链cDNA输入开始
  • 种系遗传snv和Indels的检测
  • 副本数变型检测
  • 相关基因组区域的杂交捕获(即,exome)或感兴趣的成绩单

好处

只需在机器人上加载试剂,点击'run,',让工作站自动化您的NGS库准备结束到结束。

  • 8个样品在2小时50min
  • 用于试剂+耗材30美元/样本
  • 甲板PCR消除了中途的人类干预
  • <15分钟的实践准备

确认

本申请已经过度测试,并科学验证了试剂合作伙伴Swift Biosciences和Omega Bio-Tek。

查看我们的应用笔记概述Swift Biosciences验证过程这里

查看我们的应用说明概述了Omega Bio-Tek验证过程这里

应用程序数据

从100ng大肠杆菌基因组DNA构建的每个文库导致近似的产率差,在单次运行中以6%CV(变异系数)测序的最小所需量。用特异于Illumina P5和P7适配器的引物扩增文库,以在10个分度PCR循环后量化文库。构建的文库显示平均峰颗粒尺寸为539bp,每个文库产生约34nm。

图1

在上面显示的OT-2上构造的库显示了具有高灵敏度NGS片段程序的安捷伦片段分析仪上预期达560bp的迹线高度。

图2.

基因组覆盖在输入DNA浓度之间保持一致。在OT-2上编写的库显示的覆盖率与手工编写的库类似或更大。

笔记

试剂

本申请已通过我们的试剂合作伙伴,Swift Biosciences和Omega Bio-Tek进行了全面测试和科学验证。我们建议您使用Swift 2S™Turbo DNA Library套件和Omega Bio-Tek Mag-Bind®Incumpurengs珠子。如果您想使用其他套件或不同的珠子,OT-2支持各种试剂用于DNA清理。

实验室

这种应用已经通过Opentrons实验室进行了验证,包括96孔PCR板、2ml管、12孔储层和Opentrons探针。如果您有不同的实验室设备要求,请联系我们的销售团队,讨论修改本协议以满足您的需求。

移液器

我们建议使用P50或P20单通道移液管和P300 8通道移液管用于此应用。如果您有不同的卷要求,请联系我们的销售团队以询问协议修改。

客户聚光灯

“我已经完成了,我不知道我生命中有多少微小的微小程度。我不想再做一次3000。”
波士顿大学的尼克·埃默里说
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客户的反馈意见